Работа с метафазами

Поиск метафаз и получение изображений

Построение рабочих процессов обработки изображений в лабораториях с высокой нагрузкой.

Автоматизация поиска метафаз и обработки изображений является одним из наиболее эффективных способов повышения пропускной способности и качества в классической цитогенетике. Несколько независимых исследований показали, что использование систем автоматической обработки изображений в цитогенетических исследованиях не только повышает количество обрабатываемых случаев, но и повышает качество анализа. Компания MetaSystems предлагает современное гибкое решение для применения в текущих анализах, основанное на автоматическом поиске метафаз (MSearch), получении изображений без вмешательства оператора (AutoCapt) и на совершенных средствах управления случаями и изображениями. Конфигурация системы сканирования препаратов Metafer, имеющей открытую структуру, может быть настроена для работы в качестве автономного рабочего места, либо в качестве части большой многопользовательской сетевой среды. В обоих случаях Neon, мощное средство управления случаями для системы Metafer, поддерживает данные случаев, отслеживает этапы обработки для всех случаев и обеспечивает обмен данными случаев с внешними источниками.

Neon, Metafer, Ikaros и Isis могут использоваться в качестве строительных блоков специализированной рабочей среды, которая может расти по мере необходимости. Если система Metafer дополнена инновационным устройством для смены препаратов SlideFeeder x80, и, возможно, считывателем штрих-кодов и дозатором иммерсионного масла, то такая система может работать круглосуточно без перерывов в качестве сервера обработки изображений. При подключении аналитических станций, имеющих доступ к базе данных случаев и изображений через платформу Neon результаты анализа немедленно попадают обратно на главный сервер.

Поиск метафаз

Основанная на системе Metafer программа поиска метафаз (MSearch) автоматически находит метафазные пластинки на любом препарате с метафазными хромосомами. Классификаторы, обучаемые пользователем, позволяют легко адаптировать её к любым способам подготовки и методам контрастирования (окрашивание по Гимзе, флуоресцентными красителями или фазо-контрастными методами). Обнаруженные метафазы автоматически отображаются в обзорной галерее и могут быть воспроизведены одним щелчком мыши. Координаты легко передаются в любой имеющийся ручной микроскоп. Благодаря прямому взаимодействию с рабочими станциями Ikaros и Isis программа поиска метафаз является мощным средством, обеспечивающим быстрый и удобный анализ хромосом.

Простая адаптация и оптимизация параметров для различных типов клеток и методов подготовки имеют критически важное значение для создания автоматизированных систем, выполняющих анализы постоянно. Для содействия в выполнении этой задачи программа поиска метафаз предоставляет весьма совершенные подпрограммы обучения и оптимизации. Галерея метафаз, формируемая в реальном времени во время поиска, предоставляет возможность быстрого просмотра обнаруженных объектов. Метафазы автоматически перемещаются под объектив микроскопа щелчком на соответствующее изображение в галерее, что позволяет провести детальное исследование глядя в окуляры или с использованием живого изображения на мониторе. При помощи мыши метафазы легко выбрать для дальнейшего анализа, исключить из анализа или удалить из галереи. Альтернативно, можно обучить классификатор поиска для назначения метафазам показателей качества, что позволит автоматически выбирать заданное число лучших метафаз.

Во время сканирования получаются также дополнительные параметры, например, митотический индекс (MI). Положения всех метафаз и ядер выводятся на экран, и метафазы могут выбираться интерактивно или автоматически. Если сканируются клональные образцы, то программа поиска метафаз может даже выбрать заданное число объектов в каждом клоне, и записать номер клона в метаданных метафазы.

Требуется помощь?

Автоматическая съёмка

Автоматическая съёмка метафаз в высоком разрешении (AutoCapt) эффективно повышает уровень автоматизации при ежедневном анализе метафаз. Каждая система Metafer создает список координат, содержащий положения всех обнаруженных объектов. Эти позиции автоматически транслируются, и изображения объектов в этих позициях снимаются на основе параметров, заданных в классификаторе. После съёмки платформа Neon немедленно включает изображения в базу данных и делает их доступными для любой подключенной рабочей станции.

Возможна очень тонкая настройка метода получения изображения. Например, после поиска метафаз все обнаруженные объекты могут быть автоматически сортированы по их показателям качества. Система может снять заданное число лучших метафаз. Однако, для получения общей картины могут быть дополнительно сняты некоторые случайно выбранные метафазы. Объекты могут сниматься как необработанные изображения, либо могут подвергаться обработке. Поддерживается функция съёмки с расширенным фокусом, а также до 12 различных цветовых каналов, например, для автоматического получения метафаз FISH или mFISH. Объекты автоматически центрируются на изображении, а если они больше, чем одно поле зрения камеры, то возможно получение нескольких изображений для одной позиции.

Автоматизированный дозатор иммерсионного масла (AutoOiler) исключает любое человеческое вмешательство между процессом поиска метафаз и получением изображения. Если установлено устройство SlideFeeder x80, платформа Metafer может самостоятельно и непрерывно проводить поиск и съёмку до 800 препаратов, не требуя вмешательства специалиста. Поэтому система может снимать изображения всю ночь и даже все выходные и праздники.

Требуется помощь?

Downloads