Клиническая цитогенетика, Генетика злокачественных опухолей и Клеточная биология

  • Цитогенетика
  • Гематология
  • Клиническая онкология
  • Иммунология
  • Поиск редких клеток

Учитывая, с одной стороны, ответственность перед пациентами и, с другой стороны, растущий спрос и возрастание затрат, врачи, работающие в области цитогенетики и генетики раковых заболеваний, оказываются зажатыми между этими двумя крайностями. Однако, компания MetaSystems, автоматизируя утомительную, но критически важную работу по анализу изображений, даёт средства для снижения давления и помогает поддерживать, или даже повышать, стандарты качества при значительном сокращении времени обработки одного случая.

Проектирование рабочего процесса

В клинических институтах данные обычно поступают из многих различных, зачастую независимых, источников. Например, данные пациента могут поступать из центральной информационной системы лаборатории, образцы поступают с лабораторного стола и идентифицируются штрих-кодами, а изображения либо генерируются системой автоматического сканирования, либо получаются вручную на станции съемки. Дополнительно могут быть внешние файлы, которые должны храниться вместе со всеми остальными данными.

Платформа Neon позволяет объединить и организовать все эти различные наборы данных, и предоставляет удобный инструмент для добавления результатов анализов, полученных вручную или автоматически. Таким образом, Neon дает совершенно новый уровень управления рабочим процессом. В системе Neon используется инновационный сверхзащищенный формат данных, а информация организуется и отображается чрезвычайно эффективным настраиваемым способом. Пользователи системы Neon имеют постоянный простой доступ к точной информации о состоянии случаев, к истории изображений, к результатам анализов и многим другим данным. Облегчают ежедневную работу, импорт и экспорт данных, в том числе, с пользовательскими полями, и возможность составления глобальных отчетов по нескольким приложениям.

Требуется помощь?

Автоматизированный анализ образцов

Автоматизированная обработка изображений – основная область компетентности компании MetaSystems. Компания MetaSystems является производителем системы Metafer, широко известной системы полностью автоматизированного сканирования препаратов. Metafer является расширением платформы Neon, и ее данные могут быть использованы на любом этапе специализированного рабочего процесса. В цитогенетических лабораториях система Metafer может использоваться, к примеру, для поиска метафаз и для получения изображений высокого разрешения. После этого автоматизированного этапа изображения могут использоваться на любой рабочей станции с системой анализа изображений Ikaros.

Анализ FISH-сигналов в клетках также может автоматически производиться системой Metafer с использованием тщательно разработанных алгоритмов анализа изображений. Конечно же, система Metafer прекрасно согласована с постоянно растущим ассортиментом ДНК-зондов нашей партнерской компании MetaSystems Probes. После анализа все проанализированные клетки отображаются в галерее, а распределения сигналов суммируются в удобных графиках и таблицах. Непревзойденный процесс быстрого подсчета Rapid Scoring позволяет объединить стратегии ручного подсчета с преимуществами автоматического подсчета.

Требуется помощь?

Рабочие станции обработки изображений

Система Ikaros является расширением платформы Neon для кариотипирования. Программа Ikaros может работать со всеми изображениями, созданными системой Metafer. Оптимизированная структура интерфейса программы Ikaros позволяет чрезвычайно быстро и эффективно производить интерактивный анализ изображений. Программа Ikaros работает с любыми методами бэндинга хромосом, с флуоресцентным окрашиванием и с хромосомами любых видов. В небольших лабораториях можно настроить конфигурацию Ikaros в качестве автономной системы, оборудованной революционной камерой CoolCube компании MetaSystems.

Система Isis представляет собой превосходный инструмент для обработки цветных флуоресцентных изображений. Изображения программы Isis могут содержать до 12 цветовых каналов, и могут быть получены либо автоматически системой Metafer, либо от автономной станции с программой Isis. Isis поддерживает метод многоцветного FISH-анализа mFISH и многоцветный бэндинг хромосом (mBAND).

Конечно, все изображения программ Ikaros и Isis могут обрабатываться системой Neon, вместе со всеми другими данными случая (файлы Metafer, расширенные данные и документы, данные пациентов и др.).

Требуется помощь?

Иммунология

Аутоиммунные заболевания вызваны аномальными иммунными реакциями на составляющие организма. В результате могут возникнуть воспаления или даже серьезные повреждения органов. Аутоантитела находятся в сыворотке крови пациента. Их присутствие имеет важное значение для изучения аутоиммунных заболеваний в доклинической фазе, поэтому они используются в программах скрининга, направленных на выявление лиц, подвергающихся риску.

Сканирующая система Metafer позволяет рутинно анализировать флуоресцентные аутоиммунные образцы с высокой воспроизводимостью. Гарантированные условия постоянного освещения благодаря светодиодной подсветке, чётко определенным параметрам интеграции, гибкости в использовании высокопроизводительного препарата с несколькими полями и мощным алгоритмом обработки изображений являются ключевыми характеристиками Metafer для автоматической оценки аутоиммунных образцов. Непревзойдённая скорость сканирования Metafer позволяет оцифровать целый образец всего за несколько минут. Двунаправленная связь со сторонним промежуточным ПО или LIMS и сложный процесс сканирования, основанный на Файле информации поиска Search Information File (SIF), гарантируют полную интеграцию с существующими процедурами. Экранный анализ шаблонов ячеек осуществляется с помощью алгоритмов автоматизированного анализа изображений Metafer. Галерея изображений результатов, точное перемещение объектов на слайде и всеобъемлющие сводные данные гарантируют полный контроль над результатами.

Требуется помощь?

Циркулирующие опухолевые клетки

Циркулирующие опухолевые клетки (ЦОК) (Circulating tumor cells (CTC)) представляют собой клетки, которые просачиваются в сосудистую сеть или лимфатические сосуды от первичной опухоли и переносятся кровопотоком по всему телу. Таким образом, ЦОК можно рассматривать как семена для последующего роста дополнительных опухолей (метастазов). Клиническая значимость обнаружения ЦОК заключается в предположении прогноза и выживаемости, в мониторинге эффективности терапии и потенциального рецидива, а также в контроле сопротивляемости к воздействию лекарств в реальном времени.

Существует несколько известных способов выделения и/или обогащения ЦОК из периферической крови. Однако даже в обогащенных образцах ручное обнаружение и анализ ЦОК может занимать до нескольких часов, что делает данный метод неприемлемым в качестве обычного теста. Система Metafer с её способностью сочетать различные стратегии анализа в одном сканировании имеет возможность преодолеть эти ограничения. Типичный анализ образца ЦОК занимает гораздо меньше часа и может быть выполнен с учётом нескольких разных маркеров, применяемых к одной и той же клетке:

  1. DAPI для получения данных морфологии, например. Для предварительного отбора кандидатов ЦОК с использованием их размеров и/или морфологии в качестве критериев.
  2. Эпителиальные маркеры, такие как EpCAM, CK8, CK18, CK19.
  3. Мезенхимальные маркеры, такие как Vimentin и Twist.
  4. Центромерные сигналы FISH идентифицируют анеуплоидии.

Разнообразные опции фильтрации, сортировки и пересмотра популяции обнаруженных клеток способствуют быстрой проверке и полной отслеживаемости результатов.

White Paper: Metafer CTC-Application, (313.8kB)

Требуется помощь?

Downloads