信号分析

全自动荧光点计数

无人值守的自动荧光信号、信号融合和信号点分类分析。

细胞或细胞核内的点状记号分析是许多血液学和肿瘤遗传学化验的基础。构建于 Metafer 平台下的 全自动荧光信号分析系统(MetaCyte) 可以自动分析这些样本,结果准确,具有重现性。结果与细胞或细胞核图像一起存储,并可在细胞缩略图、柱状图和散点图上显示,或者作为 Neon 一个精致报告的总结表格中显示。

归功于系统极其灵活的软件结构设计,它可以轻易的适用于绝大部分图像工作。荧光通道信号可以与分析相结合,而且每个荧光通道的图像可以分别进行处理。一系列的细胞选择参数可以精确的定义目标细胞、细胞核或其它对象的形态特征,软件中有超过300个对象特征参数(如面积、形状、密度或信号分布)可以定义。由于每一个测量结果都可以返回激活触发其它特征参数,所以任何一张图像都可以经过极其复杂的分析过程。所有的参数保存在 classifier 中,作为将来实验的评分标准。保存后 classifier 可以由简单的鼠标操作激活使用,甚至可以由外部条件(如从 LIMS 或条形码读取)激活。

众多毒理学家微生物学家病理学家血液学家以及国际上很多其它领域的研究者和临床医生都在依赖拥有如此显著特征的系统,因为拥有一系列强大分析工具的 Metafer 帮助在他们工作的领域中提供了完美的图像分析解决方案。

快速计数

Metafer 对比于简单的信号点计数它可以做得更多:例如它能识别并计数不同颜色通道的融合信号。通过这种方式软件可以分析所有与基因座专一性的 MetaSystems 探针结合的样本的所有信号分组。在人工分析样本时,很多情况下操作人员会预选容易分析的细胞,并倾向于忽略不易分析的细胞。而全自动的扫描系统提供全面无偏见的分析,它会分析大量在人工分析时通常会忽略的细胞。因此,很多实验室通常会在人工观察分析时会对阳性样本用很低的异常临界值。由于在全自动和人工分析上存在以上差异,分析人员通常会花费大量的时间修正系统自动分析的结果,或者摒弃一些他们不喜欢的细胞。有 Metafer 情况后可以不同:MetaSystems 创建了快速计数系统 (Rapid Scoring /RS),一个结合了人工计数策略和自动计数系统优点的新型的 FISH 信号分析方法。所有分析的细胞都显示在缩略图中,分析后的细胞和信号分组分别通过图片库和图表的形式展现。扫描完成后技术人员可以立刻开始对有疑问的细胞进行分类,技术人员可使用外接的小键盘对每个细胞进行分类,也可以在任何时间新建一个细胞分类。同时,在自动扫描结果的左边会一个显示空白的计数图表,这份图表会随着手动分类的进行不断更新结果。此外,可以放大显示未处理的有疑问的细胞也让信号分类更加容易。

组织 FISH

Metafer 是分析单个细胞核内 FISH 信号的强有力的工具,但是它可以做得更多。如通过 Metefer 精致的软件界面轻松的分析组织切片的荧光信号。

首先,有多种用于样品预览的预扫描方法。一方面预扫描可以在单个 H&E 染色的连续切片上进行;另一方面在组织观察软件上标记感兴趣区域,然后用编辑生物组织微阵列 (Tissue Micro Array/TMA)样本的便捷工具促进高通量分析。

此外,可以应用画笔或者鼠标快捷的选择感兴趣细胞,每个在组织上或者 TMA 上标记的区域都可以载入至软件界面中并自动采集图像,而且软件可以自动分析组织中选中细胞/细胞核中的荧光信号。系统不仅会自动计数信号点,同时也会检测融合信号,信号强度定量和鉴别分离的信号点等。每个细胞的结果都展示在图像缩略图中,以便于检查和修正数据结果,而且结果可在定制的数据直方图中自动更新。完成分析后,数据结果也可以总结和打印。

细胞核选择在软件中非常简单,因为软件中已包含自动分离细胞核的特殊算法,所以图像在分析前已经用巧妙的图像处理工具进行了图像增强,只需用画笔或鼠标点击即可从已预分割的细胞核中选择要分析的细胞核。同时可以在原始图像和图像处理后的图像间快捷切换。也正因为如此,Metafer 可以成功的应用于传统的组织切片和 TMA 制备的固体肿瘤组织的诊断。

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