中期分裂相成像

中期分裂相搜寻和成像

为高通量实验室建立图像采集流程。

全自动的中期分裂相细胞搜寻和成像能大大改善传统细胞遗传学实验中工作流程的质量和工作量。不同的独立研究结果都表明在细胞遗传学领域中使用全自动成像系统不仅能降低实验室样本的平均分析周期,甚至分析的质量也能得以提高。MetaSystems 的成像系统完美结合了现代化的技术和灵活多变的元素。系统构建于全自动中期分裂相搜寻(MSearch),无人值守的全自动图像采集(AutoCapt)和精良的档案及图像数据管理设备之上,为细胞遗传学实验室的常规应用提供了完美的解决方案。同时玻片扫描平台 Metafer 具有开放性的概念,它既能作为一个独立的系统工作也可以整合到由网络连接的多用户工作环境中。而 Neon 作为 Metafer 的病例数据管理仪表板,负责管理病例的数据信息,记录和更新分析状态,而且也能够与外部数据库交换病例信息。

Neon、Metafer、Ikaros Isis 都可以在自定义的工作环境下根据需求的增长而增加配件。如果 Metafer 结合了创新性的玻片送样器 SlideFeeder x80,或再搭载条形码读取器和自动加镜油装置,就可以配置成 24/7 连续工作的图像服务器。所有已连接服务器的分析工作站都可以通过 Neon 访问图像和病例信息,并即时把分析结果反馈给主服务器。

中期分裂相搜寻

基于 Metafer 的中期分裂相搜寻(MSearch)系统能够应用任何分裂相样本搜寻分裂相细胞。由于系统基于用户可训练的分类器 classifers,所以它可以适应多种不同的制备方法和观察方式(吉母萨染色,荧光和相差等)。系统在图像预览缩略图中自动显示检测到的细胞,鼠标轻松点击就可以重新定位该细胞。而且扫描后细胞的坐标也可以很方便的转换至任何手动显微镜坐标。由于 Metafer 中期分裂相搜寻系统能够直接连接到 IkarosIsis 分析工作站,也使得它成为快速便捷分析染色体的有力工具。

能够适应不同种类的细胞和不同的样本制备方法并对其进行参数优化对全自动化系统来说是至关重要的,同时这也能够给日常分析工作提供很大的帮助。为了达成这一目标,系统提供了精细的训练参数和优化算法。另外在实时扫描过程能够自动生成分裂相缩略图,方便用户快速预览检测到的目标物。搜寻完成后,用户用鼠标点击相应的缩略图就能轻松的重定位该中期分裂相,从而方便随后在显微镜下或用相机预览图像观察其详细信息。同样在细胞缩略图中轻点鼠标也可以轻松选择需要采集图像、排除或者删除的细胞。此外,搜寻分类器 classifier 也能根据用户给细胞分裂相分配的质量评分来训练,从而系统能够自动搜寻自定义数目的最佳中期分裂相。

系统在扫描过程中也能够自动获取额外的参数如细胞有丝分裂指数(Mitotic Index, MI)等。同时系统中也会显示所有中期分裂相细胞和细胞核的位置信息,方便用户手动或自动选择分裂相细胞。如果用户扫描克隆样本,甚至能自定义每个克隆中挑选出分裂相的数量,而且每个中期分裂相都会给出相应的克隆信息。

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自动图像采集

高分辨率中期分裂相自动图像采集(AutoCapt)系统能够大大提高了传统中期分裂相分析的自动化水平。由于 Metafer 中期搜寻系统能够自动生成已找到的分裂相的位置信息,系统可以应用这些位置信息来重新定位每个中期分裂相,然后应用基于用户可自定义设置的参数来完成图像采集工作。一旦完成图像采集,Neon 就会自动获取到该图像并让所有连接的分析工作站读取和分析这些图像。

获取图像的方式也可以高度的自定义化。例如,一旦完成中期分裂相搜寻,系统可以立即根据它们的质量评分进行自动排序。当然系统也可以定制为自动获取一定数目的最佳分裂相。此外,系统也能够自动随机添加一些中期分裂相进行图像采集以提供玻片的全貌信息。另外系统既可以获取分裂相的原始图像,也可以对该原始图像进行图像处理。同时系统也支持多层聚焦,而且最多可支持拍摄 12 个不同颜色通道的图像,如自动获取 FISH 或 mFISH 的中期分裂相图像。通常系统会自动在一个相机视野内采集目标物图像, 但当目标物大于一个相机视野时系统也可以设置为在同一个位置周围采集多张图像。

自动添加镜油装置(AutoOiler)可以完全消除中期分裂相搜寻和图像采集过程之间的人工干预步骤。另外安装了 SlideFeeder x80 的实验室可以在不需要任何研究人员的监督下自动完成最多 800 张玻片的自动分裂相搜寻和图像采集。因此系统也完全可以在晚上、周末或假期继续工作。

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