Análise de Sinais

RapidScore: Automação da contagem de pontos para FISH.

Análise desacompanhada e automatizada de sinais de fluorescência, fusões de sinais e padrões de pontos.

A análise de padrões de sinais de fluorescência / pontos de FISH em células ou núcleos celulares é a base para muitos ensaios em hematologia e genética do câncer. Com o sistema automatizado de análise de sinais de fluorescência baseado na plataforma Metafer (MetaCyte), esses padrões são analisados de forma automática, precisa e reprodutível. Os resultados são armazenados em conjunto com as imagens das células ou núcleos e podem ser exibidos na galeria de imagens, em histogramas, gráficos de dispersão ou como uma tabela em um dos belos relatórios presentes no Neon.

A arquitetura ultra flexível do sistema permite realizar qualquer tarefa de imagem. Sinais de canais distintos podem ser combinados para um ensaio, e as imagens obtidas em cada canal podem ser processadas individualmente. A morfologia de células em estudo, núcleos ou outros objetos pode ser definida com precisão através de vários parâmetros de seleção de células. Mais de 300 características de objetos (por exemplo, área, forma, intensidade e distribuição de sinal) podem ser medidas. Os resultados de tal medição podem ser utilizados para acionar outros recursos, de modo que análises extremamente sofisticadas possam ser feitas para cada imagem. Todos os parâmetros são armazenados em um classificador, definindo o padrão de pontuação para muitos experimentos futuros. Uma vez criado, um classificador pode ser selecionado com alguns cliques do mouse ou até mesmo com gatilhos de externos (por exemplo, de um LIMS ou um código de barras).

As poderosas ferramentas do Metafer ajudam a fornecer soluções de análise de imagem para muitos campos de trabalho. Os toxicologistasmicrobiologistaspatologistashematologistas e muitos outros pesquisadores e clínicos em todo o mundo confiam nas características excepcionais do sistema.

RapidScore

Metafer faz muito mais do que simplesmente contar sinais: por exemplo, também é capaz de identificar e contar fusões de sinais de diferentes canais de cores. Desta forma, o software tem a capacidade de analisar todos os padrões de sinal encontrados em amostras hibridizadas como as sondas para locus especifico da MetaSystems Probes. No que diz respeito à automação da análise de sinais, muitas vezes parece que os analistas pré-selecionam células que podem ser facilmente interpretadas, enquanto tendem a ignorar as células difíceis de interpretar. O sistema de varredura automatizada fornece interpretação imparcial, pontuando muitas células que são frequentemente ignoradas através da contagem manual de pontos. Portanto, muitos laboratórios estão acostumados a trabalhar com valores de corte anormais muito baixos para positivos durante a observação manual. Como resultado dessas discrepâncias entre estratégias de pontuação automatizadas e manuais, as pessoas gastam um tempo significativo para corrigir resultados automatizados ou para rejeitar células das quais não gostam.

Com o Metafer, isso pode ser diferente: a MetaSystems criou o Rapid Scoring (RS), um novo método de análise de sinais FISH que combina estratégias de pontuação manual com as vantagens da pontuação automatizada. O RS usa o Metafer para classificar automaticamente os padrões dos sinais das células. Todas as células analisadas são exibidas em uma galeria. Padrões de sinal são resumidos em um gráfico e uma tabela convenientes. Imediatamente após a varredura, os técnicos podem começar a categorizar as células com resultados duvidosos. Categorias podem ser atribuídas a cada célula usando um teclado externo e novas categorias (grupos de células) podem ser adicionadas a qualquer momento. Uma folha de pontuação vazia exibida à esquerda dos resultados automatizados exibe dinamicamente os resultados manuais enquanto a categorização está em andamento. Uma imagem ampliada da célula não processada em questão facilita a avaliação dos padrões de sinal.

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FISH em Tecidos

Metafer é muito robusto na análise de padrões de FISH em núcleos unicelulares, porém pode fazer muito mais que isso. Sinais de fluorescência em seções de tecido, por exemplo, podem ser facilmente analisados com a interface de software dedicada do Metafer.

Em primeiro lugar, várias opções de pré varreduras podem ser usadas para fornecer visões gerais de amostras. Pré digitalizações podem ser feitas em uma amostra separada com uma subsequente seção de tecido corado com H&E. As regiões de interesse podem ser marcadas no software de visualização de tecidos, e uma ferramenta conveniente para editar padrões de tissue micro array (TMA) facilita as análises de alto rendimento.

Quando as imagens das regiões selecionadas no tecido ou no TMA são adquiridas automaticamente, elas podem ser carregadas em uma interface de usuário dedicada. Células de interesse podem ser rapidamente selecionadas através de uma caneta ou mouse. Na seleção, todos os sinais FISH na célula / núcleo selecionados são analisados automaticamente. A análise pode abranger a contagem de sinais, mas também a detecção de sinais fundidos, uma quantificação de intensidades, a identificação de sinais divididos e muito mais. Os resultados para cada núcleo são mostrados em conjunto com uma imagem da galeria, oferecendo assim a possibilidade de verificar e corrigir imediatamente os dados. O histograma de dados configurável é atualizado sempre que um núcleo adicionado à galeria. Depois de terminar a análise, os dados podem ser resumidos e impressos.

Embora a seleção do núcleo seja feita de maneira muito conveniente através da interface do software, algoritmos especiais estão disponíveis para segmentação automatizada de núcleos. Núcleos pré segmentados podem ser rapidamente incluídos na análise usando uma ponta de caneta ou um clique do mouse. Um kit de ferramentas de operações dedicadas de processamento de imagem oferece aprimoramento de imagem antes da análise. É possível alternar rapidamente entre a imagem original e a processada. Devido a esta funcionalidade, o Metafer foi utilizado com sucesso no diagnóstico de tumores sólidos, independentemente de se basear em secções de tecido convencionais ou na preparação de TMA.

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Imagem de Metáfases

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